Este Departamento es responsable de definir las polí­ticas relativas a la seguridad marí­tima, protección del medio marino, refrendo de los certificados técnicos relativos a los convenios internacionales de las embarcaciones que enarbolan la Bandera de Honduras; elaboración de dictámenes técnicos y seguimiento a la actividad de la flota mercante abanderada en Honduras que navega en el mundo.Está conformado por las secciones:

Toda solicitud que se presente a tramite ante la Sección de Receptoria de Documentos y Atención al Cliente del la DGMM deberá ser formulada necesariamente por escrito por un profesional del derecho colegiado y solvente, que acredite plenamente el mandato bajo el cual actúa.